I principi di biochimica di Lehninger 6E

Trasduzione del segnale

Rassegna sulla trasduzione del segnale

http://themedicalbiochemistrypage.org/signal-transduction.html

Questo sito presenta una rassegna molto completa (costituita unicamente da testo) dei concetti importanti nella biologia della trasduzione del segnale. Tra gli argomenti principali, un’introduzione generale su come i segnali si muovono all’interno della cellula, una spiegazione approfondita delle varie classi di recettori di trasduzione del segnale, il ruolo della membrana cellulare nella via di segnalazione e altre importanti componenti enzimatiche. Il sito è stato creato da Michael W. King della Facoltà di Medicina dell’Università dell’Indiana.

Molecole di biosegnalazione

Ormoni peptidici

http://themedicalbiochemistrypage.org/peptide-hormones.html

Questo sito rappresenta un’utile risorsa su struttura e funzione di varie famiglie di ormoni, che inducono molte importanti cascate di trasduzione del segnale nel corpo umano. Il sito include anche una tabella riassuntiva di strutture e funzioni, oltre alle descrizioni dei recettori per gli ormoni, delle molecole che fungono da secondi messaggeri e delle malattie correlate. Scritto per studenti interessati alle applicazioni mediche della biochimica, questo sito (come il precedente) è parte del sito The Medical Biochemistry Page (http://themedicalbiochemistrypage.org/index.php), creato e aggiornato da Michael W. King della Facoltà di Medicina dell’Università dell’Indiana.

Ormoni steroidei

http://themedicalbiochemistrypage.org/steroid-hormones.html

Compagno del sito sugli ormoni peptidici (descritto qui sopra), presenta le più importanti caratteristiche di ormoni steroidei quali testosterone e cortisolo e descrive il loro ruolo nella trasduzione del segnale. Come il precedente, è stato creato ed è aggiornato da Michael W. King della Facoltà di Medicina dell’Università dell’Indiana.

Biochimica della trasmissione nervosa

http://themedicalbiochemistrypage.org/nerves.html

I canali sono massicciamente implicati nella propagazione dell’impulso nervoso sia lungo una cellula nervosa sia tra neuroni (trasmissione sinaptica). Questo sito descrive i canali di membrana nel contesto dell’impulso nervoso, la loro struttura e le molecole (neurotrasmettitori) che hanno effetto su di essi. Raccomandato a studenti che possiedono nozioni di base di neurobiologia e sui canali di membrana. Anche questa sezione del sito, come le precedenti, è curata da Michael W. King della Facoltà di Medicina dell’Università dell’Indiana.

Patologie legate ai canali ionici

http://neuromuscular.wustl.edu/mother/chan.html

Senza dubbio, si tratta del più esclusivo sito web sul tema dei canali ionici, dei trasmettitori, dei recettori e delle patologie correlate. Vi troverete una descrizione di quasi tutte le proteine che legano i canali, compresi i neurotrasmettitori. Le informazioni sono disponibili in formato schematico, sfortunatamente molto conciso, ma includono collegamenti ad altre risorse. Il sito è mantenuto dal Neuromuscular Disease Center della Facoltà di Medicina dell’Università di Washington.

Galleria di strutture proteiche NMR

http://www-nmr.cabm.rutgers.edu/photogallery/structures/index.html

Questa pagina contiene i link a dozzine di strutture proteiche, determinate presso il Center for Advanced Biotechnology and Medicine, Rutgers (Università di Stato del New Jersey). Tra le strutture di proteine determinate nel laboratorio di Steven Feiler, ve ne sono un certo numero i cui domini di legame sono trattati in questo capitolo: 

IRS-1, dominio PTB

http://www-nmr.cabm.rutgers.edu/photogallery/structures/html/page31.html

Tirosina fosfatasi

http://www-nmr.cabm.rutgers.edu/photogallery/structures/html/page32.html

Plecstrina, dominio di omologia della plecstrina N-terminale

http://www-nmr.cabm.rutgers.edu/photogallery/structures/html/page34.html

Fli-1, dominio di legame al DNA

http://www-nmr.cabm.rutgers.edu/photogallery/structures/html/page35.html

Shc, dominio SH2

http://www-nmr.cabm.rutgers.edu/photogallery/structures/html/page36.html

Shc, dominio PTB

http://www-nmr.cabm.rutgers.edu/photogallery/structures/html/page38.html

Dominio di morte associato a FAS

http://www-nmr.cabm.rutgers.edu/photogallery/structures/html/page37.html

La Molecola del mese della PDB (PDB Molecule of the Month)

http://www.pdb.org/pdb/101/motm_archive.do

David Goodsell dello Scripps Research Institute ha sviluppato una meravigliosa sezione associata alla Protein Data Bank: gli articoli dedicati alla Molecola del mese (Molecule of the Month). Scritti a un livello accessibile a un non-laureato, questi articoli presentano un ottimo schema di relazioni struttura-funzione su alcune proteine ben conosciute. Le molecole di trasduzione del segnale sono state argomenti popolari di questo sito.

Proteine G

http://www.rcsb.org/pdb/101/motm.do?momID=58

Insulina

http://www.rcsb.org/pdb/101/motm.do?momID=14

Tirosina chinasi Src

http://www.rcsb.org/pdb/101/motm.do?momID=43

Canali del Potassio

http://www.rcsb.org/pdb/101/motm.do?momID=38

Calmodulina

http://www.rcsb.org/pdb/101/motm.do?momID=44

La pompa del calcio

http://www.rcsb.org/pdb/101/motm.do?momID=51

Proteina fluorescente verde (GFP)

http://www.rcsb.org/pdb/101/motm.do?momID=42

Recettore degli estrogeni

http://www.rcsb.org/pdb/101/motm.do?momID=45

Soppressore dei tumori p53

http://www.rcsb.org/pdb/101/motm.do?momID=31

Regolazione della biosegnalazione: regolazione del ciclo cellulare, oncogeni, geni soppressori dei tumori e morte cellulare programmata

Le vie dei processi cellulari – Il ciclo cellulare

http://www.genome.ad.jp/kegg/pathway/hsa/hsa04110.html

Apoptosi

http://www.genome.ad.jp/kegg/pathway/hsa/hsa04210.html

Questo database giapponese fa parte di KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) e mappa le vie metaboliche e regolatorie, fornendo collegamenti a informazioni specifiche su ciascun componente delle vie. Gli enzimi sono specificati utilizzando il numero identificativo EC (Enzyme Commission). Cliccate sul numero di un enzima o sul nome di un composto per maggiori informazioni. Utilizzate il menu a tendina per selezionare una specie su cui avere informazioni più dettagliate. La portata delle informazioni qui disponibili è enormemente vasta. KEGG è stato creato ed è manutenuto dall’Institute for Chemical Research dell’Università di Kyoto.

Oncogeni e Cancro

http://themedicalbiochemistrypage.org/oncogene.html

Soppressori dei tumori e Cancro

http://themedicalbiochemistrypage.org/tumor-suppressors.html

Fattori di crescita e Citochine

http://themedicalbiochemistrypage.org/growth-factors.html

In queste tre lezioni troverete una trattazione approfondita degli argomenti da una prospettiva biochimica e medica; queste pagine fanno parte del sito, vincitore di vari premi, The Medical Biochemistry Page, a cura di Michael W. King della Facoltà di Medicina dell’Università dell’Indiana.