I principi di biochimica di Lehninger 6E

Il complesso della nitrogenasi

La molecola del mese della PDB (PDB Molecule of the Month)

La nitrogeneasi

http://www.rcsb.org/pdb/101/motm.do?momID=26

David Goodsell dello Scripps Research Institute ha sviluppato una meravigliosa sezione associata alla Protein Data Bank: gli articoli dedicati alla molecola del mese (Molecule of the Month). Scritti a un livello accessibile a un non-laureato, questi articoli presentano un ottimo schema di relazioni struttura-funzione su alcune proteine ben conosciute. Visitate questo sito per esplorare questo sorpredente enzima responsabile della fissazione dell’azoto.

Biosintesi degli amminoacidi

Metabolismo degli amminoacidi

http://themedicalbiochemistrypage.org/amino-acid-metabolism.html

La prima sezione di questo sito ricco di informazioni tratta in modo approfondito la biosintesi degli amminoacidi non essenziali, mentre la seconda sezione è dedicata alla scissione e al riciclaggio degli amminoacidi. Include anche un link a un vasto sito sulle conseguenze dei difetti genetici negli enzimi implicati nel metabolismo degli amminoacidi. Il sito è caldamente consigliato agli studenti di biochimica interessati alla medicina. Creato da Michael W. King della Facoltà di Medicina dell’Università dell’Indiana.

Prodotti specializzati del metabolismo amminoacidico

http://themedicalbiochemistrypage.org/aminoacidderivatives.html

Oltre al loro ruolo primario di componenti delle proteine, agli amminoacidi sono anche i precursori di un certo numero di altre importanti molecole. Il sito analizza in dettaglio la sintesi di alcune di queste molecole, tra cui vari neurotrasmettitori, la creatina, le poliammine, il glutatione e l’ossido di azoto (NO). È un ottimo sito per apprezzare la complessità e l’interconnessione delle vie metaboliche. Creato da Michael W. King della Facoltà di Medicina dell’Università dell’Indiana.

Metabolismo di eme e porfirine

http://themedicalbiochemistrypage.org/heme-porphyrin.html

Un esauriente sito web che tratta la complessità della biosintesi dell’eme in modo molto dettagliato e fornisce informazioni sulle numerose malattie causate da difetti del metabolismo dell’eme e dei derivati porfirinici. Le informazioni generali che si trovano su questo sito possono essere utili a studenti di tutti i livelli, ma il materiale è principalmente indirizzato a studenti dei corsi superiori di biochimica, specialmente a quelli interessati alla medicina. Scritto da Michael W. King della Facoltà di Medicina dell’Università dell’Indiana.

Metabolismo di eme e ferro

http://library.med.utah.edu/NetBiochem/hi.htm

Un’introduzione al ruolo di eme e ferro nel metabolismo, con numerosi collegamenti ipertestuali. Il sito copre un’ampia gamma di argomenti, tra cui la regolazione della sintesi del gruppo eme, la captazione del ferro, il suo trasporto e immagazzinamento, le malattie derivanti da difetti nel metabolismo dell’eme, ecc.

Sul sito trovate anche una serie di domande per mettere alla prova le vostre conoscenze e potrà esservi utile la visione di una breve animazione sulla struttura delle uroporfirine, alla pagina http://library.med.utah.edu/NetBiochem/movies/porphyri.mov.

http://library.med.utah.edu/NetBiochem/movies/porphyri.mov

Parte di NetBiochem, è stato creato da James Baggot (Università Allegheny di Scienze della Salute) e Sharon Dennis (Università dello Utah).

Biosintesi dei nucleotidi

Panoramica del metabolismo di purine e pirimidine

http://library.med.utah.edu/NetBiochem/pupyr/pp.htm

Il sito presenta una rassegna sul metabolismo dei nucleotidi di importanza fisiologica. Inizia con una sezione, molto ben scritta, sulla nomenclatura e tratta poi le vie biosintetiche de novo e di salvataggio. Il testo è un po’ povero, ma è scritto dal punto di vista sia fisiologico sia biologico allo scopo di fornire una visione globale del ruolo del metabolismo nucleotidico. I testi sono stati scritti da Carol Angstadt (Università Allegheny di Scienze della Salute) per NetBiochem, il sito creato da James Baggot (Università Allegheny di Scienze della Salute) e Sharon Dennis (Università dello Utah).

Tabelle di biochimica di NetBiochem: metabolismo di purine e pirimidine

http://library.med.utah.edu/NetBiochem/tabletit.htm#pupy

Il sito propone un’utilissima raccolta di tabelle che riassumono i concetti principali del metabolismo dei nucleotidi. Comprende una tabella con la nomenclatura di base, una che mostra l’amminoacido che fornisce ciacun atomo dell’anello nucleotidico e ottimi confronti tra le vie biosintetiche di purine e di pirimidine (sia de novo sia di salvataggio). Vivamente raccomandato per la revisione di alcuni argomenti generali del metabolismo dei nucleotidi. È parte di NetBiochem, il sito creato da James Baggot (Università Allegheny di Scienze della Salute) e Sharon Dennis (Università dello Utah).

Il metabolismo dei nucleotidi

http://themedicalbiochemistrypage.org/nucleotide-metabolism.html

Un sito completo ed esauriente che tratta tutti gli aspetti del metabolismo dei nucleotidi, scritto per studenti di biochimica interessati alla medicina. La combinazione di testo e grafica passa in rassegna praticamente tutto ciò che riguarda i nucleotidi, in modo molto dettagliato, compresi sintesi e degradazione, regolazione, interconversione e significato clinico. Il sito comprende anche una sezione informativa dedicata al tetraidrofolato, un importante intermedio di questa e altre vie metaboliche. Il sito è vivamente consigliato a studenti dei corsi superiori di biochimica che vogliono sapere tutto sul metabolismo dei nucleotidi. È stato creato da Michael W. King della Facoltà di Medicina dell’Università dell’Indiana.

La molecola del mese della PDB (PDB Molecule of the Month)

David Goodsell, dello Scripps Research Institute, ha sviluppato una meravigliosa sezione associata alla Protein Data Bank: gli articoli dedicati alla molecola del mese (Molecule of the Month). Scritti a un livello accessibile a un non-laureato, questi articoli presentano un ottimo schema di relazioni struttura-funzione su alcune proteine ben conosciute.

La diidrofolato riduttasi

http://www.rcsb.org/pdb/101/motm.do?momID=34

La glutammina sintetasi

http://www.rcsb.org/pdb/101/motm.do?momID=30

Questo enzima-chiave della regolazione determina quali amminoacidi e quali nucleotidi vengono sintetizzati in risposta alle condizioni sempre mutevoli della cellula. Esplorate in questa pagina la struttura e la funzione di questa enorme proteina.