I principi di biochimica di Lehninger 6E

Un singolo filamento di DNA è lo stampo per copiare l’intera molecola – L’esperimento di Mesleson-Stahl

http://www.dnaftb.org/dnaftb/20/concept/index.html

Questo sito costituisce la lezione 20 di un meraviglioso sito sul DNA, DNA from the Beginning, sviluppato dal Dolan DNA Learning Center del Cold Spring Harbor Laboratory. Il sito comprende 41 lezioni organizzate in tre gruppi principali, dedicati rispettivamente alla genetica classica (Classical Genetics), alle molecole della genetica (Molecules of Genetics), e all’organizzazione e al controllo genico (Genetic Organization and Control). Oltre all’ottima presentazione e all’eccellente livello delle informazioni, il sito è unico nel presentare il volto umano delle scoperte scientifiche.

Ciascuna lezione prevede una descrizione del concetto principale, alcune animazioni che presentano lo sviluppo del concetto dal punto di vista (e con le sembianze) degli scienziati che hanno eseguito gli esperimenti-chiave, un’intervista a un ricercatore del settore, un problema per testare la comprensione dell’argomento e infine una pagina di collegamenti utili.

Gli acidi nucleici

http://library.med.utah.edu/NetBiochem/nucacids.htm

Un testo molto ben scritto su tutti gli aspetti legati agli acidi nucleici, dalla sintesi all’organizzazione nel nucleo, molto approfondito. Comprende anche molte informazioni sull’RNA. Questa rassegna concisa e organizzata per punti rappresenta un valido aiuto per gli studenti per ripassare molti importanti concetti di biologia molecolare. È parte di NetBiochem, il sito curato da James Baggott e Sharon Dennis e ospitato dall’Università dello Utah.

Problemi sugli acidi nucleici

http://www.biology.arizona.edu/molecular_bio/problem_sets/nucleic_acids/nucleic_acids_1.html

Il sito presenta una serie di quiz online (a scelta multipla) su acidi nucleici, DNA e storia della scoperta del DNA come materiale genetico. Se la risposta fornita è errata, si apre una dettagliata spiegazione sull’argomento. Indirizzato a studenti dei corsi di base e avanzati, il sito fa parte di The Biology Project dell’Università dell’Arizona.

La replicazione del DNA

http://users.rcn.com/jkimball.ma.ultranet/BiologyPages/D/DNAReplication.html

Un sito ben illustrato e ricco di collegamenti che fa parte delle Kimball’s Biology Pages. Include un collegamento a un’animazione del processo di replicazione.

La subunità beta della DNA Polimerasi III di E. coli: la pinza scorrevole

http://www.callutheran.edu/BioDev/omm/jmolxx/poliiib/poliiib.html

Questa presentazione, che utilizza Jmol, descrive la struttura e il meccanismo d’azione della sorpredente pinza scorrevole della subunità beta della DNA polimerasi III, la protagonista principale nella replicazione del DNA. A cura di David Marcey.

Parte dell’Online Macromolecular Museum della California Lutheran University (http://www.callutheran.edu/BioDev/omm/exhibits.htm).

La molecola del mese della PDB (PDB Molecule of the Month)

La trasposasi

http://www.rcsb.org/pdb/101/motm.do?momID=84

La DNA polimerasi

http://www.rcsb.org/pdb/101/motm.do?momID=3

La DNA ligasi

http://www.rcsb.org/pdb/101/motm.do?momID=55

Alcuni tipi di mutazioni vengono automaticamente riparati

http://www.dnaftb.org/dnaftb/28/concept/index.html

Questo sito costituisce la lezione 28 del meraviglioso sito sul DNA, DNA from the Beginning, sviluppato dal Dolan DNA Learning Center del Cold Spring Harbor Laboratory. Il sito comprende 41 lezioni organizzate in tre gruppi principali, dedicati rispettivamente alla genetica classica (Classical Genetics), alle molecole della genetica (Molecules of Genetics), e all’organizzazione e al controllo genico (Genetic Organization and Control). Oltre all’ottima presentazione e all’eccellente livello delle informazioni, il sito è unico nel presentare il volto umano delle scoperte scientifiche.

Ciascuna lezione prevede una descrizione del concetto principale, alcune animazioni che presentano lo sviluppo del concetto dal punto di vista (e con le sembianze) degli scienziati che hanno eseguito gli esperimenti-chiave, un’intervista a un ricercatore del settore, un problema per testare la comprensione dell’argomento e infine una pagina di collegamenti utili.

Alcuni DNA possono saltare

http://www.dnaftb.org/dnaftb/32/concept/index.html

La lezione 32 del sito DNA from the Beginning (illustrato qui sopra), dedicata alla scoperta di Barbara McClintock sui geni “che saltano” (trasposoni) nel mais.

Il Museo online delle macromolecole (OMM): la sala del DNA/RNA

http://www.clunet.edu/BioDev/omm/gallery.htm

Dalla pagina iniziale di OMM, cliccate sul link “exhibits” e poi scendete fino alla sala del DNA/RNA (Hall of DNA/RNA). Questa mostra include alcune lezioni che impiegano l’applet Jmol, tra cui una chiara introduzione alla struttura del DNA e una dedicata ai suoi conformeri A, Z e B, e 10 lezioni Chime sugli enzimi coinvolti in questi aspetti del metabolismo del DNA: HhaI DNA metilasi, Hin recombinasi, HIV-1 integrasi, RecA (E. coli), proteina di ricombinazione RuvA, Cre recombinasi, topoisomerasi I (E. coli), enzimi che riparano gli errori di appaiamento: MutS e MutH, e l’endonucleasi di restrizione BamHI.